Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms