Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms