Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms