Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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PKP4Q99569 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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