Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBPQ99417 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms