Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms