Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACAP3Q96P50 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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