Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms