Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BORCS6Q96GS4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms