Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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