Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms