Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms