Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms