Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms