Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL2Q92772 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL2Q92772 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms