Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms