Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms