Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCG3Q8WXD2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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