Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms