Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms