Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CLDN19Q8N6F1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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