Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms