Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMC1Q7Z7K0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMC1Q7Z7K0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms