Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms