Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCBE1Q6UXH8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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