Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms