Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM46CQ5VWP2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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