Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HES3Q5TGS1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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