Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD1Q5SYB0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms