Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms