Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms