Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms