Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms