Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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