Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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