Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CDO1Q16878 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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