Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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