Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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ALX1Q15699 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ALX1Q15699 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALX1Q15699 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
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