Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms