Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms