Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms