Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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