Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
R3HDM1Q15032 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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