Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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