Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms