Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIN2CQ14957 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms