Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IHHQ14623 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IHHQ14623 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IHHQ14623 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms