Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK13Q14004 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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