Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAPSNQ13702 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms