Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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